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前沿拓展:
當?shù)貢r間2月18日,國際頂級醫(yī)學(xué)期刊《柳葉刀》(The Lancet)在線發(fā)表了一篇通訊文章,來自8個國家的27名知名公共衛(wèi)生科學(xué)家簽署聲明:支持中國抗擊2019新型冠狀病毒疾病(COVID-19)疫情中的科研、公共衛(wèi)生、醫(yī)務(wù)工作者。
該聲明直指疫情期間出現(xiàn)的各種陰謀論。這27位科學(xué)家提到,在這次疫情中相關(guān)數(shù)據(jù)迅速、公開且透明的共享如今正受到關(guān)于該疾病起源的謠言和錯誤信息的威脅。“我們在此共同強烈譴責(zé)認為該新型冠狀病毒疾病COVID-19并非自然起源的陰謀論。”
這份聲明認為,來自世界各國的科研工作者已經(jīng)對引發(fā)該疾病的病原SARS-CoV-2的全基因組進行了分析并公開發(fā)表了結(jié)果,這些結(jié)果壓倒性地證明了該冠狀病毒和其它很多新發(fā)病原一樣來源于野生動物。
他們強調(diào),陰謀論除了制造恐慌、謠言、偏見、損害全球共同抗擊該疾病的工作外,別無它用。“我們支持世界衛(wèi)生組織總干事的呼吁:促進科學(xué)的論證和團結(jié),而非誤傳和猜想。”
這27位科學(xué)家還呼吁更多的人加入,截至發(fā)稿前,已有281人簽名支持。
科學(xué)家發(fā)文反駁“人工合成”陰謀論
2月18日,Scripps研究所的著名病毒進化學(xué)家Kristian Andersen在preprint(預(yù)印本)的virological.org上發(fā)文反駁新冠病毒“人工合成”陰謀論。
作者通過對可用基因組序列數(shù)據(jù)的比較分析推導(dǎo)出新冠病毒的起源和早期進化方法,并提供了有關(guān)新冠病毒基因組中顯著特征的觀點,基于此討論可能出現(xiàn)這些特征的場景要求。
最重要的是,該論文分析可以提供證據(jù)表明,新冠病毒不是人工合成的。
首先論文對圖中描述的α和β冠狀病毒(Coronaviridae家族)的基因組進行了比較,以此確定新冠病毒基因組所具有的兩個明顯特征:
1、基于結(jié)構(gòu)模型和早期生化實驗可知,新冠病毒針對的是人與ACE2(宿主細胞受體血管緊張素轉(zhuǎn)化酶2)受體結(jié)合;
2、新冠病毒在S蛋白的2個亞基S1/S2交界處有一個預(yù)測的多堿基切割位點。
因此Andersen先從SARS-CoV與ACE2結(jié)合最重要的RBD(受體結(jié)合結(jié)構(gòu)域)的6個氨基酸殘基,Y442、L4772、N479、D480、T487、Y4911入手。
他發(fā)現(xiàn):新冠病毒的相應(yīng)殘基為L455、F486、S494、N501、Y505,與蝙蝠冠狀病毒RaTG13相比,有5個不同。新冠病毒S蛋白中第486位殘基的苯丙氨酸(F)對應(yīng)于SARS-CoV Urbani株中的L472,但F486并不是計算生物學(xué)預(yù)測時該位置點最優(yōu)化的氨基酸選擇。
并且,新冠病毒的RBD中幾個關(guān)鍵氨基酸殘基與計算生物學(xué)預(yù)測的最適合結(jié)合人ACE2受體的氨基酸殘基也完全不同。
所以Andersen認為,從新冠病毒S蛋白結(jié)構(gòu)特征來看,新冠病毒并非是通過算法所預(yù)測最優(yōu)化的,而更像是自然選擇的。
其次,新冠病毒第2個明顯的特征是在S蛋白的2個亞基S1/S2交界處Furin蛋白酶切割位點(RRAR),除了兩個堿性精氨酸和一個切割位點的丙氨酸之外,還插入了一個脯氨酸。
脯氨酸插入產(chǎn)生的轉(zhuǎn)角結(jié)構(gòu)導(dǎo)致Furin蛋白酶切割位點側(cè)翼的S673、T678、S686發(fā)生添加O末端糖基化,而以前的β冠狀病毒均無Furin蛋白酶切割位點。
從SARS-CoV的體外實驗中可知,在S1/S2交界處突變出這樣的位點,可以增強細胞-細胞融合,但并不影響病毒進入。另外3個預(yù)測的O末端糖基化潛在功能還不清楚,但值得一提的是,它們可以產(chǎn)生一個“黏蛋白樣結(jié)構(gòu)域”,該結(jié)構(gòu)域可以屏蔽新冠病毒S蛋白上的潛在表位或者關(guān)鍵殘基。
但新冠病毒在體外培養(yǎng)體系中連續(xù)傳代極難同時獲得Furin蛋白酶切割位點和O末端糖基化。
第三個論據(jù)是病毒的宿主。新冠病毒與蝙蝠冠狀病毒RaTG13非常相似,所以蝙蝠是新冠病毒的宿主可能性很大。目前初步分析表明,非法進口到廣東的馬來穿山甲可能是新冠病毒的中間宿主。
馬來穿山甲的冠狀病毒在6個關(guān)鍵RBD殘基上都與新冠病毒相同,但不同的是,馬來穿山甲的冠狀病毒不具有Furin蛋白酶切割位點,這意味著新冠病毒可能存在其他中間宿主,病毒在這些宿主身上形成了Furin蛋白酶切割位點,然后才傳播給了人。
而病毒要在中間宿主身上實現(xiàn)這種進化的話,新冠病毒的中間動物宿主必然具有極高的密度,這樣自然選擇才能快速發(fā)生。
因此從新冠病毒的S蛋白結(jié)構(gòu)特征、早期進化以及人工合成所具備的條件等方面來看,新冠病毒是自然的選擇,而不是合成的。
有人忙著“抗疫”,有人忙著“抹黑”
自疫情爆發(fā)以來,有關(guān)新冠病毒是“人工合成”的論調(diào)層出不窮。
最早有人扒出曾與2015年發(fā)表在Nature上的一篇論文,并以此為據(jù),稱新冠病毒是人為制造的。
該論文闡述的是研究人員用SARS-CoV反向遺傳系統(tǒng),生成并鑒定了一種類似SARS新型冠狀嵌合病毒。
在體內(nèi)實驗中證明,嵌合病毒在小鼠肺中的復(fù)制具有明顯的發(fā)病機理,能夠感染小鼠呼吸道細胞并引發(fā)嚴重急性呼吸系統(tǒng)綜合征。這項研究可以表明,蝙蝠種群中流行的病毒,可能會再次導(dǎo)致像SARS那樣的傳播風(fēng)險。
該研究由美國北卡羅萊納大學(xué)教堂分校主導(dǎo),石正麗是該論文的作者之一,而她現(xiàn)在擔(dān)任中科院武漢病毒所研究員,于是這一巧合之下,不少陰謀論開始滋生。
“疫情源頭是實驗室病毒泄露”、“病毒是美國人制造的”等傳言,流傳于網(wǎng)絡(luò)上,這篇論文成為了這類謠言的論據(jù)。
與此同時,不甘寂寞的印度也搞出了一個“大新聞”。
印度德里大學(xué)和印度理工學(xué)院的研究人員在bioRxiv的預(yù)印本上發(fā)表了一篇論文稱:“在新冠病毒突刺蛋白中發(fā)現(xiàn)4個插入序列,其與HIV-1gp120和Gag高度相似,而這4個插入序列均為新冠病毒獨有,在其他冠狀病毒中不存在。”
該論文將新冠病毒與引發(fā)“非典”疫情的類似冠狀病毒的基因組進行了對比,分析了二者存在差異的地方,然而發(fā)現(xiàn)了與艾滋病毒的關(guān)聯(lián)。論文摘要中寫道:4個獨特的插入序列都與HIV-1關(guān)鍵結(jié)構(gòu)蛋白中的氨基酸殘基具有同一性,這在自然界中不太可能是偶然的。
需要強調(diào)的是:bioRxiv網(wǎng)站不是學(xué)術(shù)期刊,在這上面刊登的論文,無需經(jīng)過同行審閱,可由學(xué)者自行刊發(fā)。
這篇論文發(fā)表后遭到了學(xué)術(shù)界強烈質(zhì)疑。
美國弗雷德·哈欽森癌癥研究中心研究員、全球聯(lián)合分析新冠病毒基因組項目的領(lǐng)導(dǎo)者之一的特雷弗·貝德福德就表示,“該論文不該發(fā)表。”因為從新冠病毒的基因上來看,根本沒有基因工程的證據(jù),病毒變異完全符合自然進化規(guī)律。
貝德福德還指出,該論文得出的結(jié)論在很多層面上都是錯誤的,所謂的4個插入序列并不是獨一無二的,它們也不是插入的,而是天然的。
最終這篇未經(jīng)審稿的論文以撤稿結(jié)束。
如今在Andersen的這篇論文發(fā)布后,眾多國際著名病毒學(xué)家紛紛轉(zhuǎn)載這篇文章并支持駁斥了新冠病毒人工合成陰謀論。在科學(xué)的強有力證明下,一些在社交媒體上推崇新冠病毒人工合成論的人被瘋狂“打臉”后,刪除了他們的陰謀論。
針對持續(xù)出現(xiàn)的陰謀論聲音,世衛(wèi)組織總干事譚德塞此前強調(diào)。“錯誤的信息使醫(yī)衛(wèi)人員的工作更加困難,它轉(zhuǎn)移了決策者的注意力、引起混亂,并向公眾傳播恐懼。世衛(wèi)組織目前不僅僅是在與病毒斗爭,還在與散布虛假信息、破壞疫情應(yīng)對工作的人員斗爭。”
在近日舉辦的美國科學(xué)促進會會議上,西雅圖弗雷德·哈欽森癌癥研究中心研究員特雷·貝德福德也駁斥了“新冠病毒是基因工程人為制造”這一聳人聽聞的“發(fā)現(xiàn)”。德福德反駁稱:“沒有任何基因工程的證據(jù)。我們所掌握的證據(jù)是,病毒的突變與自然進化完全一致。”
“美國羅格斯大學(xué)(Rutgers University)生物學(xué)家理查德·埃布萊特(Richard H. Ebright)對BBC說,根據(jù)目前對病毒的基因組測序,沒有任何證據(jù)表明該病毒經(jīng)過人工改造,埃布萊特曾在《自然》對武漢病毒所的一項蝙蝠病毒實驗表示關(guān)注。
俄羅斯國家杜馬教育和科學(xué)委員會第一副主席、前總防疫師奧尼先科敦促:“不要人為制造恐慌,不要導(dǎo)致事態(tài)升級,不要試圖進行信息恐怖襲擊。”
新冠患者首份病理報告出爐
2月17日,《柳葉刀·呼吸醫(yī)學(xué)》(The Lancet Respiratory Medicine)在線發(fā)表了首份新冠肺炎病理學(xué)報告。
這份名為 Pathological findings of COVID-19 associated with acute respiratory distress syndrome(COVID-19 與急性呼吸窘迫綜合征的病理關(guān)系)的報告,是全球首篇對新冠肺炎死亡患者病理檢查的文獻記錄。
該論文研究團隊來自解放軍總醫(yī)院第五醫(yī)學(xué)中心,通訊作者之一為中科院院士,解放軍總醫(yī)院第五醫(yī)學(xué)中心感染性疾病診療與研究中心主任王福生教授。
在最新研究中,王福生團隊通過在患者死后穿刺獲取組織樣本,分析了一名死于新冠病毒嚴重感染伴嚴重急性呼吸綜合征患者的病理特征。
研究團隊在論文中寫道:“COVID-19 病理特征與嚴重急性呼吸綜合征(SARS)、中東呼吸綜合征(MERS)的冠狀病毒感染非常相似。”
值得一提是,在這篇論文發(fā)表前一天,武漢金銀潭醫(yī)院于2月16日凌晨起先后實施了兩例新冠肺炎患者遺體解剖手術(shù),預(yù)計10天以內(nèi)可以得出結(jié)論。不同于尸檢取樣,完整的遺體解剖病理研究有望在本文病理學(xué)新發(fā)現(xiàn)的基礎(chǔ)上,為探索新冠肺炎患者臨床病理改變,疾病機制更進一步。
病理研究為何重要?
南方醫(yī)科大學(xué)第三附屬醫(yī)院呼吸內(nèi)科的主任醫(yī)師程遠雄表示,目前對新冠肺炎的診斷主要基于血液檢查的炎癥因子等數(shù)據(jù),推測該病毒可能在呼吸道、消化道、心血管系統(tǒng)、肝臟等系統(tǒng)引發(fā)損傷;而病理解剖有助于解答哪些是新冠肺炎帶來的原發(fā)性損傷,哪些是繼發(fā)性損傷;以及為什么不同的病人感染新冠肺炎癥狀不同。
參考鏈接:
http://www.caixin.com/2020-02-18/101517239.html
http://www.whb.cn/zhuzhan/kjwz/20200220/326391.html
https://tech.sina.com.cn/csj/2020-02-19/doc-iimxxstf2704137.shtml
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