我國科學家公布藏羚染色體水平高質量基因組
記者近日從中國科學院西北高原生物研究所獲悉,該研究所研究員張同作聯合青海大學副教授魏青等團隊,成功組裝藏羚染色體級別的基因組,獲得藏羚染色體水平的高質量基因組和注釋信息。相關研究結果發表在國際學術期刊《自然》旗下綜合性科學期刊《科學數據》上。
藏羚是國家一級保護動物,主要分布在青??煽晌骼铩⑽鞑厍继痢⑿陆柦鹕降茸匀槐Wo區,在維持青藏高原生態系統平衡中具有重要作用,是研究高海拔適應性機制和遷徙行為的良好模型。但目前公開數據庫中仍缺少藏羚高質量的染色體水平基因組,嚴重限制了基于遺傳特征解析其物種適應、進化及種群生態相關工作的開展。
這是藏羚基因組的組裝和注釋結果。(受訪單位供圖)
通過多種測序技術,研究團隊成功組裝了藏羚染色體級別的基因組。張同作表示,數據評估表明組裝的連續性好,完整度和準確性高;藏羚基因組中重復序列注釋結果表明,藏羚基因組重復序列總長度為1.65GB,占基因組的52.47%,同時在藏羚基因組上共注釋到28330個功能基因。
張同作介紹,此次成功組裝藏羚染色體級別的基因組,將為藏羚的適應進化遺傳機制、保護遺傳學研究及進一步探索物種遷徙行為的遺傳機制提供重要基因組資源。(記者陳杰)
來源: 新華社
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