在中央空調機組的維護中，為了直流冷卻系統的有效運行，有必要控制傳熱表面的結垢。使用聚磷酸鹽或有機聚合物可以大大降低系統流的沉積潛力。除了阻礙熱傳遞之外，沉積物還會改變流動特性，導致沉積物下的腐蝕，增加泵送功耗，并釋放腐蝕產物來污染暴露在直流水中的工藝流。

直流系統中常見的水垢是硬度鹽，如鈣、鎂，與陰離子如碳酸鹽、硫酸鹽、二氧化硅結合。錳和鍶不太常見，但在該國的一些地區，它們是麻煩的規模化生產商。氧化鐵等腐蝕產物也可能是水垢形成的重要因素。泥漿和污泥也會增加直流系統中沉積物的形成。

隨著溫度的升高，溶解度降低，形成水垢，防垢化學品可以通過多種方式實現防垢，通常使用特殊的化學品來盡量減少碳酸鈣水垢。在直通系統中減少軟化的鈣在經濟上是不切實際的，因為要處理大量的水。

當使用特殊化學品時，沉積物控制劑必須通過允許成鹽垢在過飽和條件下存在而不沉淀來防止晶體生長和結垢。常用的試劑包括多磷酸鹽、有機磷酸鹽和有機聚合物。根據系統條件，處理水平從小于1 ppm到5 ppm不等。

鐵沉積是直通系統中的另一個特殊問題。鐵可能從井水或地表水進入系統，或者由于系統的腐蝕。在任何情況下，沉積控制劑都可以用來控制沉積。聚磷酸鹽、有機磷酸鹽、表面活性化合物和聚電解質用于此目的。活性化合物的治療水平從低于1ppm到5ppm不等。在更高的層次上，分批處理已被用來清除舊的鐵礦床。

近年來，在通過系統中使用聚電解質進行沉積物控制變得更加普遍，電力行業率先使用處理水平非常低的專有聚合物來解決特定的沉積物控制問題。丙烯酸酯和丙烯酰胺系列聚合物已被證明在高容量直通系統中有效，即使在以十億分之幾計量的加工水平下也是如此。

微生物活動形成的沉積物在通過系統時特別麻煩。由生物體形成的沉積物限制了熱傳遞，并且經常導致嚴重的腐蝕沉積物。此外，生物體充當無機物種的基質粘合劑，增加沉積量和韌性。此外，嚴重的宏觀生物污染基本上可以阻止水流在短時間內通過換熱處理設備。

在中央空調船舶的維護中，生物污染控制，如氯和溴氧化劑，已通過冷卻系統用于微生物控制。氧化劑的處理頻率、持續時間和水平因系統和水源的性質而異。為直通系統設計微生物控制程序時，必須考慮當前和未來的環境限制。